Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ1

Abraxas2, BRISC complex subunit Abraxas 2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas2Q3TCJ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abraxas2Q3TCJ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abraxas2Q3TCJ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas2Q3TCJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms