Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam171bQ14CH0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam171bQ14CH0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam171bQ14CH0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam171bQ14CH0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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