Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dusp27Q148W8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dusp27Q148W8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dusp27Q148W8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dusp27Q148W8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Dusp27Q148W8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Dusp27Q148W8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dusp27Q148W8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Dusp27Q148W8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dusp27Q148W8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dusp27Q148W8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms