Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc39dQ0VF76 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttc39dQ0VF76 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc39dQ0VF76 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms