Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Shisal1Q0VBP7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms