Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q08AU9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q08AU9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q08AU9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q08AU9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q08AU9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q08AU9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q08AU9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q08AU9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q08AU9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q08AU9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q08AU9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q08AU9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q08AU9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q08AU9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q08AU9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q08AU9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q08AU9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q08AU9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q08AU9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q08AU9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q08AU9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q08AU9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q08AU9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q08AU9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q08AU9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q08AU9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q08AU9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q08AU9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q08AU9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q08AU9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q08AU9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q08AU9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q08AU9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q08AU9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q08AU9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q08AU9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q08AU9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q08AU9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q08AU9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q08AU9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q08AU9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q08AU9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q08AU9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q08AU9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q08AU9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q08AU9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q08AU9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q08AU9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q08AU9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q08AU9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q08AU9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q08AU9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q08AU9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q08AU9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q08AU9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q08AU9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q08AU9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q08AU9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q08AU9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q08AU9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q08AU9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q08AU9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q08AU9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q08AU9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q08AU9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q08AU9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q08AU9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q08AU9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q08AU9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q08AU9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q08AU9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q08AU9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q08AU9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q08AU9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q08AU9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q08AU9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms