Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssrp1Q08943 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssrp1Q08943 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssrp1Q08943 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms