Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MitfQ08874 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MitfQ08874 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MitfQ08874 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MitfQ08874 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MitfQ08874 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MitfQ08874 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MitfQ08874 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MitfQ08874 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MitfQ08874 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MitfQ08874 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MitfQ08874 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MitfQ08874 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms