Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn1Q05186 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcn1Q05186 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcn1Q05186 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms