Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1Q04750 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1Q04750 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1Q04750 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1Q04750 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1Q04750 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1Q04750 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top1Q04750 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top1Q04750 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top1Q04750 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top1Q04750 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top1Q04750 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top1Q04750 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top1Q04750 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Top1Q04750 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms