Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PrkczQ02956 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkczQ02956 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkczQ02956 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkczQ02956 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkczQ02956 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkczQ02956 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkczQ02956 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms