Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax5Q02650 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax5Q02650 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax5Q02650 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms