Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd1Q02242 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd1Q02242 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd1Q02242 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms