Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VldlrP98156 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VldlrP98156 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VldlrP98156 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VldlrP98156 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VldlrP98156 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VldlrP98156 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VldlrP98156 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VldlrP98156 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VldlrP98156 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms