Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apba2P98084 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Apba2P98084 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apba2P98084 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apba2P98084 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apba2P98084 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apba2P98084 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apba2P98084 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apba2P98084 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Apba2P98084 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Apba2P98084 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Apba2P98084 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Apba2P98084 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apba2P98084 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms