Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfcP97953 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfcP97953 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfcP97953 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfcP97953 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfcP97953 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfcP97953 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfcP97953 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfcP97953 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfcP97953 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfcP97953 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfcP97953 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfcP97953 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfcP97953 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfcP97953 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfcP97953 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfcP97953 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfcP97953 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms