Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra1P97785 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra1P97785 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms