Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
rp9P97762 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
rp9P97762 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
rp9P97762 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
rp9P97762 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
rp9P97762 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
rp9P97762 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
rp9P97762 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
rp9P97762 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
rp9P97762 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
rp9P97762 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
rp9P97762 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
rp9P97762 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
rp9P97762 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
rp9P97762 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
rp9P97762 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
rp9P97762 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
rp9P97762 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
rp9P97762 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
rp9P97762 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
rp9P97762 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
rp9P97762 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
rp9P97762 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
rp9P97762 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
rp9P97762 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
rp9P97762 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
rp9P97762 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
rp9P97762 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
rp9P97762 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
rp9P97762 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
rp9P97762 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
rp9P97762 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
rp9P97762 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
rp9P97762 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
rp9P97762 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
rp9P97762 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
rp9P97762 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
rp9P97762 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
rp9P97762 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
rp9P97762 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
rp9P97762 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
rp9P97762 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
rp9P97762 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
rp9P97762 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
rp9P97762 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
rp9P97762 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
rp9P97762 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
rp9P97762 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
rp9P97762 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
rp9P97762 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
rp9P97762 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
rp9P97762 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
rp9P97762 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
rp9P97762 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
rp9P97762 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
rp9P97762 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
rp9P97762 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
rp9P97762 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
rp9P97762 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
rp9P97762 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
rp9P97762 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
rp9P97762 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
rp9P97762 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
rp9P97762 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
rp9P97762 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
rp9P97762 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
rp9P97762 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
rp9P97762 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
rp9P97762 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
rp9P97762 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
rp9P97762 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
rp9P97762 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
rp9P97762 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
rp9P97762 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
rp9P97762 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
rp9P97762 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
rp9P97762 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
rp9P97762 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
rp9P97762 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
rp9P97762 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
rp9P97762 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
rp9P97762 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
rp9P97762 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
rp9P97762 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
rp9P97762 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
rp9P97762 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
rp9P97762 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
rp9P97762 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
rp9P97762 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
rp9P97762 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
rp9P97762 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
rp9P97762 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms