Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmklr1P97468 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmklr1P97468 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmklr1P97468 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmklr1P97468 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmklr1P97468 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmklr1P97468 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmklr1P97468 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms