Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43cP86449 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43cP86449 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim43cP86449 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43cP86449 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms