Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-Q6P79568 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-Q6P79568 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Q6P79568 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms