Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb6P70689 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gjb6P70689 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb6P70689 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms