Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh9P70407 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh9P70407 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh9P70407 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh9P70407 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms