Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtnP63089 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtnP63089 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtnP63089 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtnP63089 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtnP63089 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtnP63089 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtnP63089 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtnP63089 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtnP63089 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtnP63089 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtnP63089 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtnP63089 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtnP63089 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtnP63089 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtnP63089 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtnP63089 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtnP63089 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtnP63089 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtnP63089 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtnP63089 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtnP63089 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtnP63089 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtnP63089 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtnP63089 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtnP63089 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtnP63089 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtnP63089 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtnP63089 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtnP63089 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtnP63089 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtnP63089 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtnP63089 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtnP63089 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtnP63089 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtnP63089 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtnP63089 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtnP63089 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtnP63089 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtnP63089 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtnP63089 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtnP63089 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtnP63089 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtnP63089 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtnP63089 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtnP63089 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtnP63089 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtnP63089 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtnP63089 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtnP63089 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtnP63089 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtnP63089 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtnP63089 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtnP63089 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtnP63089 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtnP63089 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtnP63089 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtnP63089 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtnP63089 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtnP63089 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtnP63089 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtnP63089 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtnP63089 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PtnP63089 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PtnP63089 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtnP63089 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtnP63089 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtnP63089 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtnP63089 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtnP63089 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtnP63089 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtnP63089 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtnP63089 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtnP63089 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtnP63089 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtnP63089 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtnP63089 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtnP63089 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtnP63089 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtnP63089 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtnP63089 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtnP63089 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtnP63089 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtnP63089 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtnP63089 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtnP63089 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtnP63089 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtnP63089 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms