Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d2P62838 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d2P62838 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d2P62838 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d2P62838 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d2P62838 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d2P62838 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d2P62838 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d2P62838 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d2P62838 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d2P62838 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d2P62838 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms