Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tbpl1P62340 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbpl1P62340 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbpl1P62340 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms