Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps29P62274 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps29P62274 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps29P62274 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps29P62274 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps29P62274 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps29P62274 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rps29P62274 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rps29P62274 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rps29P62274 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rps29P62274 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps29P62274 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps29P62274 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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