Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga11P61622 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga11P61622 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga11P61622 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga11P61622 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga11P61622 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itga11P61622 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itga11P61622 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga11P61622 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga11P61622 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga11P61622 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga11P61622 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga11P61622 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga11P61622 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga11P61622 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga11P61622 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga11P61622 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga11P61622 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms