Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Smg6P61406 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Smg6P61406 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Smg6P61406 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Smg6P61406 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Smg6P61406 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Smg6P61406 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Smg6P61406 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smg6P61406 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smg6P61406 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smg6P61406 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Smg6P61406 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smg6P61406 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smg6P61406 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Smg6P61406 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Smg6P61406 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smg6P61406 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smg6P61406 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smg6P61406 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smg6P61406 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smg6P61406 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smg6P61406 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms