Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Polr2fP61219 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2fP61219 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2fP61219 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2fP61219 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms