Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sem1P60897 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sem1P60897 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sem1P60897 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sem1P60897 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sem1P60897 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sem1P60897 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sem1P60897 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sem1P60897 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sem1P60897 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sem1P60897 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sem1P60897 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sem1P60897 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sem1P60897 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sem1P60897 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sem1P60897 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sem1P60897 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sem1P60897 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sem1P60897 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sem1P60897 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sem1P60897 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sem1P60897 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sem1P60897 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sem1P60897 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sem1P60897 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sem1P60897 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sem1P60897 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sem1P60897 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sem1P60897 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sem1P60897 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sem1P60897 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sem1P60897 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms