Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snap25P60879 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snap25P60879 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snap25P60879 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snap25P60879 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snap25P60879 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snap25P60879 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap25P60879 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Snap25P60879 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snap25P60879 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap25P60879 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snap25P60879 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap25P60879 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap25P60879 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snap25P60879 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms