Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nphp4P59240 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Nphp4P59240 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nphp4P59240 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nphp4P59240 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nphp4P59240 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nphp4P59240 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nphp4P59240 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nphp4P59240 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Nphp4P59240 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nphp4P59240 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nphp4P59240 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nphp4P59240 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms