Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rhbdl3P58873 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rhbdl3P58873 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rhbdl3P58873 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rhbdl3P58873 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rhbdl3P58873 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rhbdl3P58873 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rhbdl3P58873 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdl3P58873 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rhbdl3P58873 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rhbdl3P58873 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rhbdl3P58873 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rhbdl3P58873 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rhbdl3P58873 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1112.1 ms