Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm6sf1P58749 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tm6sf1P58749 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm6sf1P58749 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tm6sf1P58749 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm6sf1P58749 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms