Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paxbp1P58501 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxbp1P58501 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms