Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtnsP57757 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtnsP57757 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtnsP57757 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtnsP57757 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtnsP57757 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtnsP57757 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtnsP57757 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtnsP57757 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtnsP57757 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtnsP57757 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtnsP57757 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtnsP57757 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtnsP57757 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtnsP57757 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtnsP57757 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtnsP57757 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtnsP57757 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtnsP57757 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms