Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc4rP56450 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mc4rP56450 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms