Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CartptP56388 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CartptP56388 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CartptP56388 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CartptP56388 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CartptP56388 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CartptP56388 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CartptP56388 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CartptP56388 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CartptP56388 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CartptP56388 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CartptP56388 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CartptP56388 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CartptP56388 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CartptP56388 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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CartptP56388 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CartptP56388 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CartptP56388 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CartptP56388 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CartptP56388 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CartptP56388 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CartptP56388 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CartptP56388 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CartptP56388 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CartptP56388 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CartptP56388 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CartptP56388 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CartptP56388 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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CartptP56388 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CartptP56388 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CartptP56388 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CartptP56388 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CartptP56388 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CartptP56388 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CartptP56388 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CartptP56388 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CartptP56388 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CartptP56388 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CartptP56388 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CartptP56388 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CartptP56388 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CartptP56388 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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