Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3bp1P55194 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1P55194 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sh3bp1P55194 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3bp1P55194 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp1P55194 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms