Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aqp4P55088 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aqp4P55088 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms