Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acod1P54987 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acod1P54987 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acod1P54987 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acod1P54987 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acod1P54987 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acod1P54987 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acod1P54987 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acod1P54987 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acod1P54987 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acod1P54987 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acod1P54987 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acod1P54987 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms