Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacnb3P54285 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacnb3P54285 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Cacnb3P54285 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacnb3P54285 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms