Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pms2P54279 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pms2P54279 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pms2P54279 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pms2P54279 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pms2P54279 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pms2P54279 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pms2P54279 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pms2P54279 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pms2P54279 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pms2P54279 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pms2P54279 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pms2P54279 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pms2P54279 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pms2P54279 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms