Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RabggtbP53612 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtbP53612 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtbP53612 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms