Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcnfP51944 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcnfP51944 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnfP51944 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnfP51944 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CcnfP51944 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcnfP51944 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcnfP51944 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcnfP51944 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcnfP51944 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnfP51944 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcnfP51944 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CcnfP51944 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcnfP51944 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CcnfP51944 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CcnfP51944 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CcnfP51944 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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