Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa11P50709 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa11P50709 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa11P50709 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa11P50709 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa11P50709 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 467.2 ms