Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb42P49222 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb42P49222 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb42P49222 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb42P49222 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb42P49222 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb42P49222 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb42P49222 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb42P49222 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb42P49222 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb42P49222 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb42P49222 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epb42P49222 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epb42P49222 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb42P49222 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb42P49222 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epb42P49222 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epb42P49222 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epb42P49222 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Epb42P49222 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb42P49222 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb42P49222 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms