Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod6P48986 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod6P48986 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Neurod6P48986 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod6P48986 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod6P48986 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod6P48986 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod6P48986 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod6P48986 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod6P48986 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod6P48986 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod6P48986 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod6P48986 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod6P48986 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod6P48986 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod6P48986 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Neurod6P48986 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod6P48986 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod6P48986 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod6P48986 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod6P48986 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod6P48986 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod6P48986 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod6P48986 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod6P48986 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms