Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tulp2P46686 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tulp2P46686 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tulp2P46686 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tulp2P46686 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tulp2P46686 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms